Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABCD3P28288 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ABCD3P28288 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms