Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PRKCHP24723 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PRKCHP24723 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms