Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 LINC01837-201ENST00000590021 1320 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
HOXB3P14651 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms