Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
ITGA4P13612 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms