Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GP1BBP13224 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms