Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ACTN1P12814 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms