Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
PKHD1P08F94 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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