Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GJB1P08034 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GJB1P08034 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB1P08034 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB1P08034 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB1P08034 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB1P08034 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GJB1P08034 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms