Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CENPBP07199 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPBP07199 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPBP07199 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPBP07199 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CENPBP07199 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CENPBP07199 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms