Protein–RNA interactions for Protein: O96028

NSD2, Histone-lysine N-methyltransferase NSD2, humanhuman

Predictions only

Length 1,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD2O96028 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NSD2O96028 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSD2O96028 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSD2O96028 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSD2O96028 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NSD2O96028 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms