Protein–RNA interactions for Protein: O95352

ATG7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG7O95352 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ATG7O95352 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ATG7O95352 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG7O95352 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms