Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
DCTN3O75935 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms