Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKNO60260 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKNO60260 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PRKNO60260 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRKNO60260 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRKNO60260 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKNO60260 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKNO60260 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKNO60260 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKNO60260 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRKNO60260 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms