Protein–RNA interactions for Protein: O15079

SNPH, Syntaphilin, humanhuman

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Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNPHO15079 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AP000640.1-201ENST00000525337 879 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SNPHO15079 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SNPHO15079 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SNPHO15079 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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