Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
BCKDKO14874 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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