Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOC4-APOC2K7ER74 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms