Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E9PBE3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E9PBE3 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E9PBE3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E9PBE3 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
E9PBE3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
E9PBE3 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E9PBE3 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E9PBE3 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E9PBE3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E9PBE3 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E9PBE3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E9PBE3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
E9PBE3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
E9PBE3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
E9PBE3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
E9PBE3 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms