Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
LINC00312Q9Y6C7 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
LINC00312Q9Y6C7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms