Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
POMPQ9Y244 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms