Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SLC12A4Q9UP95 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SLC12A4Q9UP95 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms