Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CYTH4Q9UIA0 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms