Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC9

NPC1L1, Niemann-Pick C1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPC1L1Q9UHC9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NPC1L1Q9UHC9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms