Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NKX1-2Q9UD57 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms