Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CTSFQ9UBX1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms