Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU6

FAM8A1, Protein FAM8A1, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM8A1Q9UBU6 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FAM8A1Q9UBU6 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms