Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
COPG2Q9UBF2 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COPG2Q9UBF2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms