Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z9

CCDC180, Coiled-coil domain-containing protein 180, humanhuman

Predictions only

Length 1,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC180Q9P1Z9 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CCDC180Q9P1Z9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC32.95■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CCDC180Q9P1Z9 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms