Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Y5

CAMSAP3, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP3Q9P1Y5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CAMSAP3Q9P1Y5 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms