Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PDP1Q9P0J1 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PDP1Q9P0J1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms