Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJC28Q9NX36 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms