Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
ATG3Q9NT62 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ATG3Q9NT62 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms