Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
HOMER3Q9NSC5 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms