Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.05■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SERINC1Q9NRX5 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SERINC1Q9NRX5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms