Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPC4

A4GALT, Lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4GALTQ9NPC4 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
A4GALTQ9NPC4 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms