Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CENPJQ9HC77 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms