Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZS1

POLR1E, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1EQ9GZS1 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
POLR1EQ9GZS1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms