Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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FOXQ1Q9C009 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FOXQ1Q9C009 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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