Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
YTHDF1Q9BYJ9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms