Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GSDMCQ9BYG8 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms