Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BBS2Q9BXC9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms