Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HIRIP3Q9BW71 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HIRIP3Q9BW71 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms