Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTV4

TMEM43, Transmembrane protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM43Q9BTV4 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
TMEM43Q9BTV4 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms