Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TIMM29Q9BSF4 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TIMM29Q9BSF4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms