Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PMCHL2Q9BQD1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms