Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQA5

HINFP, Histone H4 transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HINFPQ9BQA5 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HINFPQ9BQA5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms