Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

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Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PCNX1Q96RV3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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