Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG2

JSRP1, Junctional sarcoplasmic reticulum protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JSRP1Q96MG2 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
JSRP1Q96MG2 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
JSRP1Q96MG2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 299.6 ms