Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNBD2Q96M20 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms