Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C9orf72Q96LT7 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C9orf72Q96LT7 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms