Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SGCZQ96LD1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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